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高通量测序产品技术咨询FAQ

Q:12201ES不同测序深度Coverage 解读?

Coverage(基因组覆盖度)是指测序获得的序列占整个基因组的比例,反映了测序数据对基因组的覆盖程度。其解读需结合测序深度理解:(1)测序深度定义:通常以“×”表示,例如10×测序深度指平均每个基因组位置被测序reads覆盖10次,200×则为200次。(2)覆盖度与深度的关系:一般情况下,测序深…

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Q:12201ES构建得到的文库产量低

文库产量低可能由以下原因导致:(1) DNA 质量低,样本中含抑制物(抑制酶活性等):Input DNA制备过程中带入的高浓度金属离子、螯合剂或其他盐,可能影响末端修复及A 尾添加等步骤的反应效率,。建议DNA 在TE 溶液中进行片段化,避免在无菌超纯水中操作。(2)RNA 污染:样本中存在RNA …

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Q:12201ES文库电泳的时候条带异常

文库电泳时出现条带异常,主要原因及对应解决方式如下:(1)出现小片段(60-120bp):此类小片段通常为接头片段或接头形成的二聚体,可使用12601ES DNA磁珠进行纯化以去除;(2)文库富集后出现大片段:文库接头长度一般约120bp,若文库片段扩增幅度超过120bp可能是PCR扩增过度导致片段…

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Q:12204ES酶切法建库试剂盒针对哪些样本建库效果比较好?

OnePot/OnePot II DNA 建库试剂盒针对基因组 DNA 和 cDNA 均可获得高产高质的文库。以下为具体应用案例及参数:(1)案例背景:客户使用逆转录获得的双链 cDNA(ds cDNA全长约 1.1kb,需酶切至 300bp 左右用于文库构建。(2)操作参数:Input DNA 量…

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Q:12204ES gDNA 片段化参考说明书酶切条件酶切 20 min,依然片段偏大是什么原因?

若使用本公司gDNA片段化产品按说明书酶切条件(20 min)酶切后仍未达到预期效果,建议优先排查以下问题:(1)DNA质量问题:Input DNA中若引入高浓度金属离子、螯合剂或其他盐离子,可能抑制酶活性。建议将 DNA稀释至ddH₂O或不含 EDTA 的10 mM Tris Buffer ((p…

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Q:12204ES酶切时间不长,但仍然出现过度酶切的情况,是什么原因?

在酶切反应中,即使酶切时间较短,仍可能出现过度酶切现象。例如,以300 bp 插入片段的白细胞基因组DNA(gDNA)为例,若采用30℃、10 min的酶切条件,可能会出现过度酶切现象。本产品建议在进行酶切时,需根据不同样本的基因组DNA大小调整反应条件。对于白细胞等基因组DNA相对较小的样本,应适…

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Q:12204ES酶切法建库,如何做到较好的质量控制?

酶切法建库过程中,需从多维度进行质量控制以确保文库质量,具体如下:(1)文库浓度检测:可采用Qubit荧光定量法或qPCR法,其中Qubit法通过特异性结合dsDNA的荧光染料实现浓度精准定量,qPCR 法则基于实时荧光定量原理,二者均能有效评估文库浓度; (2)文库长度检测:使用琼脂糖凝胶电泳(推…

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Q:12205ES片段化模块酶是内切酶还是外切酶?单酶还是混合酶?能否用于其他应用?

本产品(片段化模块酶)是随机内切酶,属于单酶体系。(1)酶类型:为随机内切酶,可对DNA进行随机切割;(2)酶体系:单酶制剂;(3)应用范围:适用于DNA片段化(如用于二代测序文库构建等场景),但酶切后产生粘性末端,需后续进行末端修复。反应条件:建议初始投入量范围为500 pg 1000 ng,在3…

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Q:12207ES 和 13468ES 有什么区别?

12207 适用于构建以 50 ng 为起始量的 DNA 文库,13468 适用于构建以 1 ng 为起始量的 DNA 文库。两者的核心区别在于试剂盒中酶的浓度存在差异:酶浓度不匹配可能导致模板 DNA 片段化不完全或片段大小偏大,进而使最终文库与预期结果产生偏差。因此,强烈建议根据实际的 DNA …

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Q:12199ES 和 12201ES的区别是什么?如何选择?

12199ES 与 12201ES 建库试剂盒的核心区别在于扩增模块的设计。具体选择建议如下:(1)若需高产量扩增,推荐使用 12199ES 建库试剂盒,其扩增模块适配高效扩增需求,可提升样本中目标核酸的产量;(2)如后续实验对扩增保真度要求较高(例如进行单核苷酸多态性(SNP)检测等精准分析),则…

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Q:12201ES 12199 12200 建库一次需要多少磁珠?

磁珠用量参考如下表(具体用量需根据实际建库体系体积及样本类型调整):(1)12199(Canace 血液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量为体系体积的 1.8 倍(例如 100 μL 体系需 180 μL 磁珠);(2)12200(Canace 唾液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量…

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Q:12201ES为什么末端修复/加 A 步骤需要开热盖而接头连接不开?

末端修复/加 A 步骤需开启热盖的原因如下:(1)末端修复反应体系中,部分酶促反应(如 Taq 酶介导的延伸反应)在 72℃ 高温下进行,若热盖关闭,反应过程中产生的冷凝液会回流至反应管内,导致反应体系体积损失或局部浓度变化,影响酶活性及反应效率;(2)接头连接反应通常在较低温度(如 16℃ 左右)…

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Q:12201ES针对FFPE 样本建库,有没有特殊的建议?

针对FFPE样本建库,建议如下:(1)对于低质量FFPE样本,可使用石蜡样本修复试剂(Cat#12606)以优化文库质量。该试剂能在末端修复步骤中同步完成样本修复,无需额外实验操作,有助于提升文库产量。(2)操作时需注意严格按照产品说明书进行样本预处理及建库流程,确保实验条件(如温度、时间等)符合要…

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