产品12907ES中包含的是随机内切酶,该酶作用于双链DNA(dsDNA),产生的末端为黏性末端。本产品暂不支持直接作用于RNA。
可以使用单酶(Cat#12907ES)搭配机械法流程建库试剂盒(如Cat#12199)进行建库。但本公司建议购买完整试剂盒(Cat#12204),该试剂盒经过流程优化,可获得优异的建库表现。若选择使用Cat#12907ES搭配其他品牌建库试剂盒,建议在片段化后先进行纯化,再衔接其他品牌建库试剂盒。
片段化酶切模块(货号:12907ES)可适用于 MGI 平台,具体使用需遵循该平台的标准操作流程。
若使用本公司gDNA片段化相关产品(如酶切试剂)按说明书酶切条件(20 min)仍出现酶切不完全的情况,可优先考虑以下因素:(1)DNA质量问题:Input DNA中若含有高浓度金属离子螯合剂(如EDTA)或其他盐离子,可能会抑制酶活性,建议将DNA稀释至ddH₂O或不含EDTA 的 10 mM T…
在酶切反应中,即使酶切时间较短,仍可能出现过度酶切现象。例如,以300 bp 插入片段的白细胞基因组DNA(gDNA)为例,若采用30℃、10 min的酶切条件,可能会出现过度酶切现象。本产品建议在进行酶切时,需根据不同样本的基因组DNA大小调整反应条件。对于白细胞等基因组DNA相对较小的样本,应适…
本产品具备小片段保护机制,在常规实验条件下,最低可实现约150 bp的片段切割。
本产品主要应用于以下领域:(1)多基因分型,可用于复杂基因组中多个目标基因的检测与分型分析;(2)食品病原微生物检测,能够快速、准确地识别食品中潜在的致病微生物,保障食品安全。
本产品的保存温度为2~8℃,不建议在-20℃条件下保存,以确保试剂性能的稳定性和有效性。
13321ES和13322ES的主要区别在于适用的样本起始量:(1)13321ES适用于样本起始量为10 ng - 1 μg的场景;(2)13322ES适用于样本起始量为500 pg - 1 μg的场景。
本产品的片段化效果与样本量和酶切时间相关,具体表现为:(1)酶切时间越长,片段化后的产物长度越短;(2)产品设置了小片段保护机制,最短可达到100~150bp左右;(3)建议按照说明书推荐的样本投入量进行操作,若超出推荐范围,需自行摸索合适的反应体系。
酶切法片段化后,若片段大小与预期不符,可从以下方面排查:(1)样本质量:需确认样本纯度是否正常,若样本中杂质(如蛋白、盐离子等)较多,可能会影响酶活性,进而导致片段化效果异常。(2)操作因素:检查酶切反应的时间把控是否准确,过度酶切或酶切不充分均可能导致片段大小偏离预期。建议片段化体系在冰上配置,以…
12204ES 为完整的建库试剂盒,包含片段化模块、连接模块及扩增模块,适用于从起始样本到完成文库构建的全流程需求。12609ES 为片段化模块,可同时完成样本的片段化、末端修复及加 A 流程,需配合其他模块(如连接、扩增模块)共同使用以完成文库构建。12907ES 为单酶(原料酶),仅用于 DNA…
12606与12608搭配使用时,可共用一种反应Buffer,在同一管中依次进行损伤修复、末端修复及加A反应。具体操作建议参照各产品说明书中的标准反应体系与条件,确保反应条件匹配以获得最佳效果。
该模块可与以下试剂盒的接头连接模块配套使用:(1)OnePot DNA 建库试剂盒(货号:12203)、;(2)酶切法建库试剂盒(货号:12205)
OnePot DNA 建库试剂盒可实现片段化、末端修复/A 尾添加、接头连接三步一管完成建库。具体对应建库模块及替代方案如下:(1)片段化/末端修复/加 A 模块:可使用货号 12609 试剂盒完成;(2)接头连接模块:可使用货号 12607 试剂盒完成;(3)文库扩增模块:可使用货号 12621…
12620ES 适合用于甲基化样本的扩增。本产品针对甲基化样本的扩增需求进行了优化,可有效实现甲基化样本的特异性扩增,满足相关实验研究的要求。
本产品相较于 2 Super Canace Ⅱ High-Fidelity Mix 的优势体现在:(1)完全克服了常规高保真酶无法以 dUTP 为原料进行聚合反应的问题;(2)可兼容含有 dUTP 的扩增引物;(3)可使用含有 dUTP 的 DNA 作为扩增模板。
连接反应中若连接buffer混合不充分(如未充分混匀),可能导致酶与底物接触不充分,进而影响连接效率,最终造成文库产量降低。为确保连接反应混合均匀,建议通过以下方式操作:(1)将反应管上下颠倒10 次;(2)使用漩涡混合器短暂混匀3 秒。
12606(Canace)可修复的损伤包括:(1)胞嘧啶脱氨成尿嘧啶(C→U);(2)碱基氧化损伤;(3)3’端封闭损伤;(4)切刻(nick)损伤;(5)gap(缺口)损伤。目前暂不支持修复DNA片段化和DNA-蛋白质交联等损伤。