前沿资讯突破抑制屏障!翌圣耐抑制Taq酶,赋能分子POCT产业升级
在分子生物学研究与临床检测领域,PCR技术的高效性离不开核心工具 ——DNA聚合酶的稳定支撑。DNA聚合酶,是以亲代DNA为模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一类酶。1957 年,DNA聚合酶Ⅰ(DNA polymeraseⅠ,简称polⅠ)首次在大肠杆菌中被发现,开启了DNA复制研究的新纪元;1988 年,Saiki等从耐热菌 Thermus
在分子生物学研究与临床检测领域,PCR技术的高效性离不开核心工具 ——DNA聚合酶的稳定支撑。DNA聚合酶,是以亲代DNA为模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一类酶。
1957 年,DNA聚合酶Ⅰ(DNA polymeraseⅠ,简称polⅠ)首次在大肠杆菌中被发现,开启了DNA复制研究的新纪元;1988 年,Saiki等从耐热菌 Thermus aquaticus中分离出来的Taq DNA聚合酶是最有名的热稳定DNA聚合酶之一,它实现了长时间的反应稳定性,为PCR方法的改进提供了无限可能。
Taq DNA聚合酶全长由832个氨基酸残基组成,分子量为94 kDa,包括三个主要结构域,其三维立体结构如图所示。

图1. Taq DNA聚合酶的三维立体结构
位于 N 端第 1-291 位氨基酸构成了 5’-3’核酸外切酶活性结构域,可应用于TaqMan探针的水解;第 292-423 位氨基酸构成了 3’-5’核酸外切酶结构域,但该结构域没有活性;第 424-832 位氨基酸构成了5’-3’聚合酶活性结构域,该结构域的三维立体结构如同人的右手,可分为拇指区、手指区和手掌区。
其中拇指区负责维持DNA聚合酶与引物-模板复合物的紧密结合,进一步有助于 DNA聚合酶的延伸;手指区负责结合dNTPs;手掌区是二价金属离子结合的活性区域,负责调节结合的dNTPs与引物 3’-OH端发生反应时周围的化学环境,从而介导和催化反应的进行。
然而,在分子 POCT 等场景中广泛应用的直接PCR扩增技术,无需核酸提取步骤、操作简便快速,但面临着样本中大量抑制物影响PCR扩增的严峻挑战。如何让Taq酶在抑制物存在的情况下,依然保持高度的活性、特异性和灵敏度,成为技术突破的关键。
依托翌圣 ZymeEditor™酶改造平台,研究人员基于DNA聚合酶的结构解析与多来源酶序列比对,通过定点诱变、随机突变定向筛选、压力测试及酶蛋白片段重组等多种技术手段,对 Taq DNA聚合酶进行全方位定向改造,获得了一系列优势突变体。
接着,团队借助 MTPS 高通量筛选技术,从热稳定性、亲和力、聚合活性、外切活性等多维度筛选后,针对目前拭子直扩等终端应用场景,进一步拆解影响酶活性的关键因素,优化筛选压力,最终改造出抑制物耐受性较强的Taq酶-Hieff UNICON® Robust Hotstart Taq DNA Polymerase(Cat#14325)。
测试7个Taq酶突变体,进行不同前处理后检测外切活性,结果显示:正常超声2 min,拭子对外切活性无影响;若是震荡处理出现明显絮状物,会降低酶的外切活性。

图2. Taq酶突变体不同处理条件下外切酶活性测试
通过长片段PCR扩增,测试水、采样拭子本身、直扩裂解液在两种条件下对聚合酶活性的影响,结果显示:拭子本身对聚合酶活性无显著影响,裂解液会抑制酶的聚合活性。

图3. 不同处理条件下长片段PCR扩增结果
将采样后的咽拭子置于直扩裂解液中震荡处理,与TE溶液,分别作为模板稀释液,得到相同浓度的模板,同时采用14325配置的qPCR体系和市面上同类产品进行扩增,结果显示:14325体系具有更好的抑制物耐受性,支持拭子样本直接扩增。

图4. 14325及市面上同类产品拭子样本直扩性能比较
将真实血浆样本,与TE溶液,分别作为模板稀释液,得到相同浓度的模板,同时采用14325配置的qPCR体系和市面上同类产品进行扩增,结果显示:14325体系具有更好的抑制物耐受性,基本可耐受30%终浓度的血浆样本直扩。

图5. 14325及市面上同类产品血浆样本直扩性能比较
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