前沿资讯T4 RNA连接酶2 | T4 RNA Ligase 2,环状RNA研究核心酶原料
T4 RNA Ligase 2在对双链RNA缺口进行连接时,展现出了极高的连接效率。

图1. T4连接酶作用原理比较[1]
T4 RNA Ligase 2,是一种依赖于ATP的双链RNA连接酶(double-strand RNA ligase, dsRNA Ligase),具有RNA链分子间和分子内连接活性,可连接双链RNA中的切刻,也可用于连接双链结构中RNA 3´羟基与DNA 5´磷酸基的切刻。与T4 RNA Ligase 1相比,该酶对双链RNA切刻的连接活性要明显高于对单链RNA的末端连接。
T4 RNA Ligase 2能够通过三步反应将相邻的3´羟基与5´磷酸多核苷酸连接起来,其机理如下:
①连接酶与ATP反应形成酶-AMP复合中间体;
② AMP脱离酶-AMP复合体,与RNA的5’-磷酸结合,形成5’端腺苷化的RNA;
③ 5’端腺苷化的RNA与3’-OH连接形成磷酸二酯键,释放AMP。

图2.T4连接酶结构与作用机理[2][3]
翌圣T4 RNA Ligase 2(Cat#14652)性能展示
连接活性强
将Yeasen和进口Supplier N*的T4 RNA Ligase 2按照不同投入量加入体系中对dsRNA底物进行连接,结果显示其能有效连接dsRNA底物,连接效果与进口Supplier N*相当。

无核酸外切酶、切口酶、RNase酶残留
将100 U T4 RNA Ligase 2分别与核酸底物一起孵育,琼脂糖凝胶电泳比较谱带变化。结果显示翌圣3个批次的T4 RNA Ligase 2均无核酸外切酶、切口酶、RNase残留。

图4. T4 RNA Ligase 2核酸外切酶、切口酶、RNase残留检测结果
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T4RNA连接酶类型 | (Cat#14651) | (Cat#14652) | K227Q(Cat#14655) | (Cat#14653) |
主要应用 | 单链RNA连接 | 双链RNA连接 | 与T4 Rnl2tr相似,但减少了副产物 | 与T4 Rnl2tr相似,但减少了副产物 |
ATP依赖性 | 是 | 是 | 否 | 否 |
连接子要求 | 不需要预腺苷化的连接子 | 不需要预腺苷化的连接子 | 需要预腺苷化的连接子 | 需要预腺苷化的连接子 |
酶活性 | 高 | 高 | 高,相比T4 Rnl2tr,减少副产物 | 高,相比T4 Rnl2tr,减少副产物,连接活性一致 |
特点 | 无特定突变 | 无特定突变 | ATP非依赖性,K227Q突变减少了酶的赖氨酸腺苷化活性 | ATP非依赖性,K227Q突变减少了酶的赖氨酸腺苷化活性, R55K突变提高了酶的连接活性 |
优势 | 广泛应用于单链RNA连接 | 广泛应用于双链RNA连接 | 减少了副产物 | 优化了连接效率,减少了副产物 |
应用 | 1. ssRNA分子内/间连接和环化; 2. ssRNA和ssDNA分子间连接; 3. 单链Oligo RNA的合成; 4.miRNA等5’端RNA在克隆、建库或PCR检测时接头添加、cDNA文库构建。 | 1. 连接双链RNA中缺刻的连接; 2. RNA 3'羟基与DNA 5'磷酸基的缺刻连接; 3. 在RNA夹板的帮助下实现ssRNA末端的连接,但不适用于短RNA前体。 | miRNA等3’端羟基的单链RNA在克隆、建库或PCR检测时接头添加、cDNA文库构建 | |
参考文献:
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