ApplicationsRNA提取常见问题及解决方案(高频避坑)
常见问题可能原因解决方案RNA降解(电泳呈弥散带,无清晰条带) a b 轻微降解:28S条带变淡,出现降解带;b严重降解:只剩18S条带或一片模糊1. 样品室温放置过久,RNase被激活;2. 器材/试剂含RNase;3. 反复冻融样品;4. 操作剧烈,RNA断裂。1. 样品取样后立即速冻或加入裂解液;2. 更换无RNase器材/试剂,DEPC水配制试剂;3
常见问题 | 可能原因 | 解决方案 |
RNA降解(电泳呈弥散带,无清晰条带)
轻微降解:28S条带变淡,出现降解带;b严重降解:只剩18S条带或一片模糊 | 1. 样品室温放置过久,RNase被激活;2. 器材/试剂含RNase;3. 反复冻融样品;4. 操作剧烈,RNA断裂。 | 1. 样品取样后立即速冻或加入裂解液;2. 更换无RNase器材/试剂,DEPC水配制试剂;3. 样品分装保存,避免反复冻融;4. 温和操作,避免剧烈震荡、吹打。 |
RNA浓度低(Nanodrop检测浓度<50ng/μL) | 1. 样品量过少;2. 裂解不充分;3. 沉淀时RNA丢失;4. 洗涤时RNA被吸走受到损失。 | 1. 增加样品量,调整样品与裂解液的比例;2. 延长裂解时间、加强研磨/吹打;3. 加入辅助沉淀剂,-20℃过夜;4. 弃上清时小心操作,避免触碰沉淀。 |
RNA纯度低(Nanodrop检测A260/A280<1.8或>2.0) | 1. <1.8:蛋白质污染;2. >2.0:RNA降解或盐离子污染;3. 多糖/多酚污染(植物样品常见)。 | 1. 蛋白质污染:增加氯仿-异戊醇抽提次数,重新沉淀;2. 盐离子污染:增加75%乙醇洗涤次数;3. 多糖/多酚污染:提取时加入PVPP(聚乙烯聚吡咯烷酮),吸附多糖/多酚。 |
RNA难以溶解(仅在trizol法中会遇到) | 1. 沉淀晾干过度;2. RNA沉淀量过多;3. 溶解时未充分静置。 | 1. 避免沉淀过度晾干,超净台中风干1-2min即可;2. 减少样品量,重新提取;3. 加入洗脱液后,室温静置10min,温和吹打,必要时37℃孵育5min辅助溶解 |
DNA污染(PCR检测有DNA条带)
| 1. 吸取水相时触碰到中层沉淀,造成DNA污染;2. 裂解不充分,DNA未完全分离;3. 样品中DNA含量过高。 | 1. 重新抽提,小心吸取水相,避免触碰中层;2. 加强裂解,延长室温静置时间;3. RNA溶解后用DNase I处理,去除残留DNA。 |
RNA提取相关产品选品指南
系列 | 兼容样本 | 主要应用 | 产品特点 | 产品名称 | 产品货号 | 产品形式 | 适配提取仪 |
磁珠法 | 适用多种动物组织如肝脏、肾脏、脾脏、心脏、皮肤、水产类等样本 | 转录组分析、基因表达分析 | RNA完整性好 | 磁珠法组织/细胞总RNA提取 | 瓶装 | 通用 | |
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植物组织 | 植物转录组分析、基因表达分析 | 适用于多糖多酚样本提取 | 磁珠法植物RNA提取 | 瓶装 | 通用 | ||
柱法 | 各种动植物、细菌组织和细胞样品 | 转录组分析、基因表达分析 | 结合了TRIzol法+离心柱,方便快捷 | 总RNA提取(带离心柱) | 瓶装 | — | |
细胞、组织 | 科胶转录组分析、Northern、点杂交、mRNA纯化等分子实验 | 15min加速提取,RNA完整度好,一次性去除gDNA | 细胞/组织总RNA提取 | 瓶装 | — | ||
转录组分析、基因表达分析 | 5min加速提取,RNA完整度好,一次性去除gDNA | 培养细胞RNA提取 | 瓶装 | — | |||
新鲜血液 | 血液基因表达分析 | TRIzol法,提取得率高 | 血液RNA提取 | 瓶装 | — | ||
植物组织、真菌组织 | 植物转录组分析、基因表达分析 | RNA完整性好 | 植物RNA提取 | 瓶装 | — | ||
多糖多样本提取效率高 | 多糖多酚植物RNA提取 | 瓶装 | — | ||||
革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌 | 细菌表达谱分析 | 搭配溶菌酶,提取效率高 | 细菌RNA提取 | 瓶装 | — | ||
动物组织、细胞 | 小RNA分析 | TRIzol法,兼容miRNA和total RNA提取 | 细胞/组织miRNA提取 | 瓶装 | — | ||
血浆、血清等液体样本 | — | 血清/血浆miRNA提取 | 瓶装 | — |


