应用方向PCR产物酶法纯化:提升你的Sanger测序数据质量!
PCR产物酶法纯化:提升你的Sanger测序数据质量!
01 PCR产物的纯化是获得高质量模板的核心
Sanger测序是一个高度精确的技术,可以逐个碱基读出DNA 序列,对模板的纯净度有着极高的要求。然而,PCR产物中的游离引物和核苷酸往往会干扰测序结果。如何在不损耗珍贵样本的前提下,获取干净、高质量的模板,是一个急需解决的难题。

图1.Sanger测序原理
在这种情况下,PCR产物的纯化成为了众多科研工作者的首选策略。传统的PCR纯化方法,如乙醇醋酸钠纯化、磁珠纯化或柱纯化,虽然有效,但往往耗时耗力,且在操作过程中容易损失样本。对于样本量有限的研究者来说,这无疑是一个相当棘手的问题。
翌圣生物提供的酶法PCR纯化法有着非常简单直接的工作流程,只有一个移液步骤。只需将核酸外切酶(Exonuclease I)和碱性磷酸酶加入PCR产物中,并在37℃静置15~30 min,即可完成纯化。这种方法不仅操作简便,而且大大减少了样本的损失,特别适合样本量有限的研究。
02 PCR酶法纯化是如何降解游离的引物和核苷酸,而不影响dsDNA目的产物
关键在于Exonuclease I!
Exonuclease I是一种对变性或单链脱氧核糖核酸具有高度选择性的核酸外切酶,作用时,Exonuclease I从引物(单链聚脱氧核糖核苷酸)的3 羟基端开始攻击,随后逐步释放出脱氧核糖核苷5 ' -单磷酸盐,但末端二核苷酸会保持完整。Exonuclease I对双链DNA或RNA无活性,因此不会降解目标产物dsDNA。接着,碱性磷酸酶将反应体系中的核苷酸去磷酸化,去磷酸化意味着反应体系中dNTP失去活性,从而不会影响测序反应。这是因为测序反应体系中的dNTP:ddNTP需要遵循特定比例,任何比例的偏差都可能引起不可预测的测序结果。(点击链接,获取更多Exonuclease I产品详情)

图2.Exonuclease I反应原理
03 PCR酶法纯化会影响后续的测序吗?
答案是:不会!
只需将反应混合物加热至80℃并保持15 min,即可使酶失活,得到干净的PCR扩增产物,直接用于测序反应。整个过程快速高效,无需额外的纯化步骤,也不会造成样本的损失。
翌圣PCR产物纯化解决方案
产品名称 | 产品货号 | 规格 |
Exonuclease I(20 U/μL) | 1000 U/5000 U | |
Shrimp Alkaline Phosphatase (SAP) (1 U/µL) | 250 U |
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站内暂未收录 · 可询价 图 2× Hieff® Robust PCR Master Mix (No Dye)
站内暂未收录 · 可询价 图 2× Hieff® PCR Master Mix for PAGE
站内暂未收录 · 可询价 图 2× Hieff® PCR Master Mix (No Dye)
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站内暂未收录 · 可询价 图 2× Hieff® PCR Master Mix (With Dye)
站内暂未收录 · 可询价 图 Endonuclease VIII 核酸内切酶VIII (10 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 Lambda exonuclease Lambda 核酸外切酶 (5 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 RNase R GMP-grade (20 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 T7 Exonuclease (10 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 RecJ Exonuclease RecJ核酸外切酶(30 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 RNase HII (2 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 T5 Exonuclease T5核酸外切酶 (10 U/µL)
站内暂未收录 · 可询价 图 10× RNase R Reaction Buffer GMP-grade
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