Case StudiesMGISP-960 在转录组测序中的应用:细胞样本的自动化文库构建流程
目的:建立适用于细胞RNA的转录组自动化建库流程平台:MGISP-960(华大智造)样本类型:细胞样本提取的DNA可选择翌圣MolPure® Magnetic Animal Tissue DNA Kit 磁珠法动物组织DNA提取试剂盒(Cat#18391)。该产品适用于从5~15 mg 动物组织样品中DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系,可最大限
目的:建立适用于细胞RNA的转录组自动化建库流程
平台:MGISP-960(华大智造)
样本类型:细胞样本提取的DNA
可选择翌圣MolPure® Magnetic Animal Tissue DNA Kit 磁珠法动物组织DNA提取试剂盒(Cat#18391)。
该产品适用于从5~15 mg 动物组织样品中DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系,可最大限度的分离纯化高纯度DNA。提取的组织DNA纯度高,质量稳定可靠,适用于各种下游应用实验,如PCR、qPCR等。本产品可配合自动化提取仪器使用,实现核酸的高通量提取。。
下游应用:
转录组测序(RNA-Seq)是利用高通量测序技术,全面获取特定细胞或组织在某一状态下所有转录产物序列及表达丰度的方法。它能够以单核苷酸分辨率精确检测基因表达水平,并发现新转录本与可变剪切事件,是解析基因功能与调控机制的核心工具。
动物细胞转录组测序的应用与研究意义
1.解析疾病发生机制与寻找生物标志物
- 研究内容:通过对比健康与患病动物组织(如肿瘤、感染组织)的转录组,识别差异表达基因、基因融合及可变剪切事件。
- 研究意义:揭示癌症、病毒感染等重大疾病的致病机理与免疫逃逸策略,为早期诊断提供特异性生物标志物(Biomarker),并为靶向药物研发提供潜在靶点。
2.探究动物生长发育与性状遗传调控
- 研究内容:追踪动物在不同发育阶段、不同组织器官或特定环境刺激下的基因表达时序性变化与调控网络。
- 研究意义:阐明细胞分化、胚胎发育及动物抗逆性等复杂性状的分子基础。例如,在畜牧育种中,可用于解析奶牛产奶、繁殖等重要性状的遗传调控机制,推进精准育种。
3.评估药物疗效与毒理反应
- 研究内容:监测动物在接受特定药物治疗或化合物处理前后,全基因组表达谱的动态响应模式。
- 研究意义:评估药物的有效性及潜在的毒副作用,阐明药物在分子水平的作用通路,从而优化给药方案并加速新药研发进程。
4.免疫学与感染研究
- 研究内容:分析动物在病原体(如病毒、细菌)感染前后的免疫应答动态,追踪免疫细胞亚群(如T细胞、巨噬细胞)的激活、分化轨迹及细胞间的信号通讯网络。
- 研究意义:揭示宿主-病原体相互作用的分子机制与免疫逃逸策略,阐明动物对特定疾病的易感性或抗性机制,为新型疫苗设计、抗病毒药物开发及动物疫病精准防控提供关键理论依据。
5.比较基因组学与进化研究
- 研究内容:跨物种比较不同动物(如灵长类、模式动物、无颌类脊椎动物等)在特定组织或发育阶段的转录组表达模式,追踪关键基因家族的演化轨迹与表达调控变化。
- 研究意义:从基因表达调控层面揭示物种形态、生理功能及复杂器官(如大脑、免疫系统)的演化起源与适应机制,填补传统基因组学在表型演化解释上的空白,深化对生命多样性的理解。
6.生物标志物发现
- 研究内容:基于大规模转录组数据,筛选与特定生理状态、疾病阶段或环境胁迫高度相关的特异性基因表达特征(Signature)及非编码RNA。
- 研究意义:为疾病的早期筛查、预后评估、疗效监测及个体化精准医疗提供高灵敏度的分子诊断工具,同时可应用于动物育种中优良性状的早期分子标记辅助选择。
建库试剂盒:
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2 mRNA捕获纯化试剂盒(Cat#12629)
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)/ 管式预混版本RNA建库试剂盒(Cat#12310)
文库类型:MGI文库
自动化耗材和数量:
耗材名称 | 品牌 | 货号 | 所需数量 |
250μL盒装滤芯透明无菌吸头 | Yeasen | 83130ES | 17盒 |
0.2mL 96孔PCR板,白色,全裙边 | Yeasen | 83560ES | 9块 |
96孔深孔板,U底(1.3 mL) | Yeasen | 83672ES | 12块 |
实验条件及结果展示:
样本序号 | 1 | 2 | 3 |
样本类型 | 细胞 | ||
物种 | 人 | 大鼠 | 小鼠 |
核酸浓度 | 187.5 | 120.5 | 466.4 |
投入量 | 350 ng | ||
RNA富集方案 | mRNA磁珠捕获 | ||
片段化条件 | 94℃ 7 min | ||
连接后纯化 | 0.55× | ||
分选条件 | 0.60×/0.15× | ||
扩增 | 14cc | ||
扩增后纯化 | 0.8× | ||
洗脱体积 | 28 μl | ||
文库浓度 | 37.6 | 38.4 | 49.8 |
片段大小:
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翌圣生物产品解决方案:
产品类别 | 产品名称 | 货号 |
核酸提取 | 18605ES | |
19221ES | ||
19231ES | ||
mRNA富集 | 12629ES | |
Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)人/小鼠/大鼠核糖体去除试剂盒 | 12257ES | |
转录组建库试剂盒 | Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version)/ 管式预混版本RNA建库试剂盒 | 12310ES |
Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dUTP) 预混/预装板式RNA建库试剂盒 | 12340ES | |
Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit (dNTP)板式RNA建库试剂盒、预混版RNA建库试剂盒 | 12341ES | |
MGI建库接头 | 13350-13353ES | |
Illumina建库接头 | Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®Set1/Set2/Set3/Set4(板式) | 12327-12330ES |
纯化磁珠 | Hieff NGS® DNA selection Beads (Superior Ampure XP alternative)DNA纯化分选磁珠 | 12601ES |
文库定量 | 12642ES | |
自动化耗材 | 83130ES | |
83560ES | ||
83672ES |
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Not listed yet IMG 1× dsDNA HS Assay Kit 即用型dsDNA qubit定量试剂
Not listed yet IMG 0.2 mL 96孔PCR板,白色,全裙边(NGS,伯乐款)
Not listed yet IMG 96孔深孔板,U底(1.3 mL)
Not listed yet


