加样体积不准。定期校正移液器,将模板高倍稀释,以大体积加入反应体系中; 定量PCR 仪器不同位置温度控制不一致,定期校准仪器;模板浓度太低。模板浓度越低,重复性越差; 做 4-6 个复孔,删除其中重复性不好的孔。
Nuclease-Free water、DEPC 水或实验室自备的 ddH2O 都可以。不推荐使用 TE 作为稀释液,TE 里有EDTA 会抑制酶的活性。
茎环法和加A法都可以用于miRNA的反转录。茎环法最大的特点是其逆转录和qPCR都是序列特异性的。但由于茎环引物的特异性,针对同一样本中不同的目的miRNA,需要配制不同的逆转录体系。简单来说,就是茎环法特异性更好,但需要设计茎环引物,并且一次逆转录只适用于一个miRNA。加A法相对更简单一些,但它…
11172属于染料法检测,11173属于探针法检测。
有效性要满足三个条件:(1)标准曲线:扩增效率范围:90-110%,对应斜率为 -3--3.5。 R2>0.98。 (扩增效率=10-1/斜率-1),当斜率=-3.32 时,扩增效率=100%。(2)扩 增曲线:S 型曲线,且 Ct 值在 15-35 之间,阴性对照 Ct>35 或无 Ct 值。(…
以 2 μL 质粒 10 倍梯度稀释液(10^6 至 10^0 拷贝)为模板扩增人 IL23R 基因,可稳定检出 7 个数量级的模板范围,扩增效率高、线性关系良好,最低可检测到 10^0(即 1 个拷贝)级别的模板。
同样的扩增产物也会出现Tm 值有微小差异,一般差异在 1 度以内都可以接受。
一般 CT 值与模板起始浓度呈负相关,浓度越高,CT 值越小。但也有很多特殊情况, 比如体系中存在抑制物或是模板不纯,这时候稀释模板反而能使 CT 值变低。
可能是目的基因为低丰度表达基因导致。建议:a)换用内参;b)换引物。
可能原因是 ROX 添加不当。确认参比染料ROX 是否添加正确。
(1)X 表示模板 DNA 量需要实验者在首次实验时进行摸索。首先对模板DNA 进行稀释(一般推荐 5-10 倍),然后模板量梯度上样,选择 CT 值落在 20-30 之间的最佳上样量。
这个是野生型的酶,活性中心封闭是利用配体法修饰的。
有末端转移酶活性。
可以使用Cat#15663ES,配方不完全一样,但可以替换。
一是该产品增强了与模板的亲和力,二是由于组分的设置,使得 RNA 最大投入量可以达到 12μL,对于低浓度模板可通过增大投入体积来增大模板投入量。
反转录后的产物是RNA和cDNA的杂交链,并不是DNA双链,其稳定性相较于后者来说要低一些。
下游通用引物是保密的。当前市面上常见到的加A法反转录试剂中,加上的带A序列是不一样的,均是根据自己的加尾酶设计并完善的,出于专利保护所以不做公开。
11149ES带有蓝色示踪剂,可提示加样进度。11150ES不带有示踪剂。经测试,添加一定量的示踪剂不影响反转录效率,后续qPCR的Ct值、熔解曲线峰值和TM值未受到负面影响。其它应用场景,如担示踪剂影响,可选11150ES。
其中的逆转录酶是通过改造后的,不具备Rnase H活性。
组分A为蓝色,具有加样示踪的作用,不建议用于下游LAMP等检测反应,可能会影响显色。