OnePot DNA 建库试剂盒可实现片段化、末端修复/A 尾添加、接头连接三步一管完成建库。具体对应建库模块及替代方案如下:(1)片段化/末端修复/加 A 模块:可使用货号 12609 试剂盒完成;(2)接头连接模块:可使用货号 12607 试剂盒完成;(3)文库扩增模块:可使用货号 12621…
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12620ES 适合用于甲基化样本的扩增。本产品针对甲基化样本的扩增需求进行了优化,可有效实现甲基化样本的特异性扩增,满足相关实验研究的要求。
本产品相较于 2 Super Canace Ⅱ High-Fidelity Mix 的优势体现在:(1)完全克服了常规高保真酶无法以 dUTP 为原料进行聚合反应的问题;(2)可兼容含有 dUTP 的扩增引物;(3)可使用含有 dUTP 的 DNA 作为扩增模板。
连接反应中若连接buffer混合不充分(如未充分混匀),可能导致酶与底物接触不充分,进而影响连接效率,最终造成文库产量降低。为确保连接反应混合均匀,建议通过以下方式操作:(1)将反应管上下颠倒10 次;(2)使用漩涡混合器短暂混匀3 秒。
12606(Canace)可修复的损伤包括:(1)胞嘧啶脱氨成尿嘧啶(C→U);(2)碱基氧化损伤;(3)3’端封闭损伤;(4)切刻(nick)损伤;(5)gap(缺口)损伤。目前暂不支持修复DNA片段化和DNA-蛋白质交联等损伤。
本公司优化的试剂可有效降低突变假阳性率,提升文库产量,并降低嵌合reads数等,以确保实验结果的准确性与可靠性。
Coverage(基因组覆盖度)是指测序获得的序列占整个基因组的比例,反映了测序数据对基因组的覆盖程度。其解读需结合测序深度理解:(1)测序深度定义:通常以“×”表示,例如10×测序深度指平均每个基因组位置被测序reads覆盖10次,200×则为200次。(2)覆盖度与深度的关系:一般情况下,测序深…
文库产量低可能由以下原因导致:(1) DNA 质量低,样本中含抑制物(抑制酶活性等):Input DNA制备过程中带入的高浓度金属离子、螯合剂或其他盐,可能影响末端修复及A 尾添加等步骤的反应效率,。建议DNA 在TE 溶液中进行片段化,避免在无菌超纯水中操作。(2)RNA 污染:样本中存在RNA …
文库电泳时出现条带异常,主要原因及对应解决方式如下:(1)出现小片段(60-120bp):此类小片段通常为接头片段或接头形成的二聚体,可使用12601ES DNA磁珠进行纯化以去除;(2)文库富集后出现大片段:文库接头长度一般约120bp,若文库片段扩增幅度超过120bp可能是PCR扩增过度导致片段…
OnePot/OnePot II DNA 建库试剂盒针对基因组 DNA 和 cDNA 均可获得高产高质的文库。以下为具体应用案例及参数:(1)案例背景:客户使用逆转录获得的双链 cDNA(ds cDNA全长约 1.1kb,需酶切至 300bp 左右用于文库构建。(2)操作参数:Input DNA 量…
若使用本公司gDNA片段化产品按说明书酶切条件(20 min)酶切后仍未达到预期效果,建议优先排查以下问题:(1)DNA质量问题:Input DNA中若引入高浓度金属离子、螯合剂或其他盐离子,可能抑制酶活性。建议将 DNA稀释至ddH₂O或不含 EDTA 的10 mM Tris Buffer ((p…
在酶切反应中,即使酶切时间较短,仍可能出现过度酶切现象。例如,以300 bp 插入片段的白细胞基因组DNA(gDNA)为例,若采用30℃、10 min的酶切条件,可能会出现过度酶切现象。本产品建议在进行酶切时,需根据不同样本的基因组DNA大小调整反应条件。对于白细胞等基因组DNA相对较小的样本,应适…
酶切法建库过程中,需从多维度进行质量控制以确保文库质量,具体如下:(1)文库浓度检测:可采用Qubit荧光定量法或qPCR法,其中Qubit法通过特异性结合dsDNA的荧光染料实现浓度精准定量,qPCR 法则基于实时荧光定量原理,二者均能有效评估文库浓度; (2)文库长度检测:使用琼脂糖凝胶电泳(推…
本产品(片段化模块酶)是随机内切酶,属于单酶体系。(1)酶类型:为随机内切酶,可对DNA进行随机切割;(2)酶体系:单酶制剂;(3)应用范围:适用于DNA片段化(如用于二代测序文库构建等场景),但酶切后产生粘性末端,需后续进行末端修复。反应条件:建议初始投入量范围为500 pg 1000 ng,在3…
本试剂盒采用转座酶进行DNA 片段化,可将传统的DNA 片段化、末端修复及接头连接等繁琐步骤整合为一步酶促反应,仅需 10分钟即可完成。
12207 适用于构建以 50 ng 为起始量的 DNA 文库,13468 适用于构建以 1 ng 为起始量的 DNA 文库。两者的核心区别在于试剂盒中酶的浓度存在差异:酶浓度不匹配可能导致模板 DNA 片段化不完全或片段大小偏大,进而使最终文库与预期结果产生偏差。因此,强烈建议根据实际的 DNA …
使用本试剂盒(货号:12207)进行文库构建时,必须进行文库扩增步骤。原因在于转座反应产物并非完整的双链DNA 文库,需通过PCR 反应生成完整的DNA文库,以满足后续测序平台(如Illumina、MGI等)的建库要求。
本产品可以作用于PCR产物,但需保证PCR产物长度>500 bp。因转座酶无法作用于DNA末端,PCR产物最末端50 bp的测序覆盖度可能会有所降低。为避免末端测序覆盖度降低,推荐在制备PCR产物时将待测区域两末端各延长50-100 bp
产品12201 适用于 500 pg至500 ng的片段化DNA 样本。