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RNaseH单酶稳定性良好。经本公司测试，该酶于4℃条件下放置11天，其rRNA去除效果仍保持正常。建议在4℃环境下短期储存（如11天内）以维持酶活性。

12258ES暂不可用于鼠的样本。该产品（一步法）目前仅适用于人的样本。若需处理鼠等样本，建议选用12257ES或12266ES等其他对应产品。

磁珠推荐选择货号12601ES。接头推荐使用双端短接头，如Cat#12414ES-12415ES，该接头支持双端 384 index标记，适用于各酶切法、机械法建库以及转录组建库等需求。建议根据样本量、测序平台选择，可参考《接头产品选购指南》。

mRNA文库构建中，链特异性文库与常规文库的核心区别在于第二条链合成时所使用的核苷酸类型：（1）常规mRNA文库：在合成第二条链时加入dTTP,（脱氧胸苷三磷酸）；（2）链特异性 mRNA文库：在合成第二条链时加入dUTP（脱氧尿苷三磷酸）。通过此差异，链特异性文库可在文库构建过程中保留RNA的原始…

本产品适用于以下应用：（1）基因表达分析；（2）单核苷酸变异检测；（3）基因融合鉴定；（4）剪切变异体分析。

12300ES适用于起始模板量为 0.1-4 μg（体积≤50 μL）的高质量动物、植物和真菌等真核生物的总 RNA。

Adapter Mix需要进行退火处理，已形成部分双链接头，完成退火后再将其用于后续的组装体系中。

本产品暂不适用多靶标CUT&Tag实验。若需同时使用多种抗体进行CUT&Tag实验，建议选用本公司的多靶标CUT&Tag试剂盒，货号为12592ES。

14555ES 提供的 buffer 中不包含 SAM（S-腺苷甲硫氨酸）或 CxSAM（S-腺苷甲硫氨酸类似物），需单独添加。具体使用浓度请参考产品说明书中的详细操作指引或相关技术文档。

接头Primer C的3’端是否需要NH₂修饰，需根据具体实验体系和需求决定。一般情况下，Tn5转座酶相关的转座体（ME）3’端常带有NH₂修饰以优化转座效率，但对于本产品（Primer C），我们测试有无NH₂修饰对对实验结果的影响不大。

CUT&Tag实验推荐使用新鲜组织并制备细胞悬液。若使用冻存组织，则需制备细胞核，同时需确保细胞核的完整性。关于植物细胞核提取方法，可咨询本公司，本公司提供完整的植物细胞核提取方案。另提供植物细胞核提取试剂盒Cat#44014ES

已知转录因子进行CUT&tag实验时，可以不通过测序，直接采用qPCR检测目的基因。需注意，qPCR检测应在文库扩增完成后进行，本公司的spike-in产品可作为内参用于相对定量。spike-in的主要作用是为实验数据的定量提供依据，类似内参功能。当目标蛋白的靶位点未知，或处理条件可能导致细胞内目标…

在进行cut&tag实验时，若出现Duplicate reads较多的情况，可尝试以下优化策略：（1）适当增加细胞投入量，以提高有效信号的覆盖度；（2）降低PCR循环数，减少扩增过程中可能引入的非特异性产物。

在相关实验中，IgG对照建议进行。IgG作为阴性对照可用于评判目标蛋白或抗体结合的特异性，通过对比IgG组与实验组的信号差异，能有效排除非特异性结合等干扰因素，确保实验结果的可靠性。

在实验过程中观测到磁珠凝聚现象，可能的原因及处理方式如下：（1）孵育时间过长（尤其是4℃过夜孵育）可能导致部分磁珠凝聚。若大部分磁珠仍处于溶液浸润范围内，通常不影响实验结果，可继续后续操作。（2）较大磁珠干结会加剧凝聚，建议避免磁珠干结，确保磁珠在实验过程中始终处于湿润状态。

不建议使用本公司试剂以外的同类试剂进行实验。本产品说明书中的实验流程（包括PCR程序等）均针对试剂盒内部配套试剂进行优化，引入非本试剂盒的试剂可能导致实验失败。若需更换试剂，建议先通过预实验验证其兼容性及实验效果。

CUT&Tag目标片段富集效果不佳可能由以下原因导致，可按对应方式改进：（1）二抗、转座体（加镁离子之前）洗涤不充分：建议增加洗涤次数或优化洗涤缓冲液配方，确保残留的非特异性结合物被充分去除。（2）抗体特异性或浓度问题：抗体特异性不足可能导致非特异性结合，需确认所选抗体是否针对目标抗原设计；抗体浓度…

（1）抗体选择：建议选用可靠的ChIP级抗体，避免选择多肽免疫制备的抗体用于CUT&Tag实验。不同转录因子与DNA的结合强度存在差异，部分转录因子可能通过与其他蛋白形成复合物结合于特定DNA片段，必要时可采用甲醛交联以增强结合稳定性。（2）样本处理与优化：弱结合的转录因子易从目标DNA上脱落，且P…

(1) 细胞或细胞核完整性不足，细胞膜或核膜破裂导致核酸提前释放，引发非特异性酶切。建议在细胞或细胞核提取过程中，通过台盼蓝染色镜检细胞活性及细胞核完整性，确保样本质量。（2）PCR扩增条件不合适，循环数过高会导致大片段非特异性扩增，进而造成条带弥散。（3）若采用抗体、磁珠等方法进行富集，需排查相关…

ATAC文库产量低可能由以下原因导致：（1）细胞核投入量不足或实验过程中细胞核部分丢失。细胞核离心后弃去上清液时易造成丢失，操作过程中建议统一EP管方向并标记细胞沉积位置，弃上清时避免触碰沉淀，同时避免剧烈涡旋振荡；（2）转座酶切割不充分或失效。首先需确认细胞核的纯度，若杂质较多可能影响转座酶效果，…