本公司建库试剂盒通常不包含接头,接头产品单独设置货号。客户可根据实验平台(如Illumina、MGI等)及样本数量等需求,选择适配的接头产品。
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12199ES 与 12201ES 建库试剂盒的核心区别在于扩增模块的设计。具体选择建议如下:(1)若需高产量扩增,推荐使用 12199ES 建库试剂盒,其扩增模块适配高效扩增需求,可提升样本中目标核酸的产量;(2)如后续实验对扩增保真度要求较高(例如进行单核苷酸多态性(SNP)检测等精准分析),则…
磁珠用量参考如下表(具体用量需根据实际建库体系体积及样本类型调整):(1)12199(Canace 血液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量为体系体积的 1.8 倍(例如 100 μL 体系需 180 μL 磁珠);(2)12200(Canace 唾液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量…
末端修复/加 A 步骤需开启热盖的原因如下:(1)末端修复反应体系中,部分酶促反应(如 Taq 酶介导的延伸反应)在 72℃ 高温下进行,若热盖关闭,反应过程中产生的冷凝液会回流至反应管内,导致反应体系体积损失或局部浓度变化,影响酶活性及反应效率;(2)接头连接反应通常在较低温度(如 16℃ 左右)…
针对FFPE样本建库,建议如下:(1)对于低质量FFPE样本,可使用石蜡样本修复试剂(Cat#12606)以优化文库质量。该试剂能在末端修复步骤中同步完成样本修复,无需额外实验操作,有助于提升文库产量。(2)操作时需注意严格按照产品说明书进行样本预处理及建库流程,确保实验条件(如温度、时间等)符合要…
1)末端修复/加 A:需使用 T4 DNA 聚合酶和耐高温 Taq 酶;2)T4 多聚核苷酸激酶(T4 PNK);3)接头连接:需使用 T4 DNA 连接酶;4)扩增模块:12201ES 对应的扩增模块为 12621/12624 高保真 DNA 聚合酶;12199ES 对应的扩增模块为 12620E…
接头连接后**不可以直接进行分选**。原因是连接反应体系中含有的Ligation Enhancer(连接增强剂)内含高浓度PEG(聚乙二醇),PEG会对后续的分选过程造成显著干扰。因此,接头连接后若需进行片段分选,必须先通过纯化步骤(如使用磁珠法、柱纯化或乙醇沉淀等方法)去除Ligation Enh…
FFPE样本修复试剂可针对石蜡样本的切口、缺刻及末端氧化情况进行有效修复。对文库构建的影响主要体现在:(1)可提升文库产量;(2)对测序质量(如Coverage等指标)无明显影响。需注意,该修复试剂的修复过程存在额外引入突变的可能性,因此肿瘤等样本的客户不建议使用。
文库片段大小分布通常受二代测序技术的读长限制、测序需求、仪器型号及测序模式(单端或双端测序)等因素影响,一般在 200-800 bp 范围内。
包含mRNA capture beads。但不包含DNA 纯化磁珠。
使用13488试剂盒合成双链cDNA后,若搭配本公司的Cat#12316ES建库试剂盒,可直接进行酶切反应构建文库,无需磁珠纯化;若搭配其他品牌建库试剂盒,建议先使用磁珠纯化双链cDNA后再进行后续建库操作。
1. RNA投入量:本产品适用于Total RNA 500 pg - 1 μg的投入量。2. 投入的RNA类型:可投入总RNA(Total RNA)。3. 引物替换建议:不建议将随机引物替换为oligo dT引物,可能会导致产量降低。若需使用oligo dT引物,需先分离mRNA后再进行逆转录反应。
可以。13488包含逆转录反应和cDNA第二链合成步骤,适用于后续的多重扩增子建库流程。
不可以。12603ES试剂盒的设计用途为从总RNA中分离mRNA,若直接使用其从组织裂解液中分离mRNA,裂解液中的组分及杂质可能会对mRNA的分离效果产生干扰。建议先按照标准流程对组织裂解液进行预处理(如去除基因组DNA、沉淀蛋白等),或选择适用于直接从裂解液中分离RNA的试剂盒。
mRNA占总RNA的比例通常为1%~5%(具体比例因样本类型而异)。若mRNA得率偏低,建议优先检查RNA是否发生降解。操作前,需使用RNase清除剂对实验台面进行清洁;操作过程中,应全程使用无酶耗材,并勤换手套,以避免RNase 污染。
12500ES 试剂盒得到的 cDNA 保存条件如下:(1)一链/二链合成后,可在-20℃保存≤48 h;(2)若进行 mRNA 94℃片段化处理,需在片段化后立即将体系降温至 4℃(或使用冰浴),以避免 Frag/Primer Buffer 在较高温度下持续作用影响片段化效果。
本产品(货号12500ES)适用于以下样本:(1)起始模板量为0.1-4 μg(体积≤50 μL)的高质量真核生物总RNA,包括动物、植物和真菌等来源的总RNA。
12500ES 适用于两种 RNA 建库场景:(1)mRNA 建库;(2)去除核糖体 RNA(rRNA)的建库。
使用核糖体去除试剂盒时,主峰附近出现的小峰可能是建库探针残留。建议通过调整分选比例(如增加或减少分选循环次数)来优化分离效果,以降低此类残留峰的影响。
针对12257产品去除rRNA过程中可能出现的残留问题,建议从以下两方面排查和优化:(1)RNase H Buffer与RNase H酶混合液的稳定性较差,建议在RNase H消化步骤中单独添加酶或现配现用混合液(配置完成后10分钟内使用完毕);(2)若混匀不彻底可能导致rRNA残留,建议使用振荡器…