-80ºC 保存没有测试过,建议用-20ºC 保存。
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用无菌水稀释即可,稀释后能保存多久暂未有明确验证数据,建议现稀释现用。
a)原理是具有 3’-5’的核酸外切酶活性,即有校正功能。b)Taq 酶错配率:2*10-4,0.0002,大约5kb 有一个碱基发生突变。Canace 约0.00039%,是 taq 酶的 52 倍。c)高保真酶是突变概率低,但不是绝对的不突变。
仅供参考:先对平末端PCR 产物纯化后,浓度要求至少 20ng/ ul(跑胶图像条带清晰,明亮即可),取 14.5 ul PCR 产物,加入 2 ul Taq Buffer,3ul dNTP,0.5 ul Taq酶,在 72℃反应 10~20min, 后直接回收纯化加A 尾的DNA 片段。
验证范围内长度理论上是可以的(验证范围:简单模板 20kb,复杂模板 10kb)。但具体能否扩出,还与模板和引物等有关。
原因 1:模板突变。 1.原始模板序列有突变。原因:原始模板序列有突变会使扩增产物的突变位点恒定,表现在多个克隆测序发生突变,且突变位置恒定。判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,测序结果与模板序列对比,发生突变且位置恒定,可认为是模板序列发生突变。优化方法:更换序列正确的模板。2.保存…
10102ES 和 10103ES 同属 2× Hieff® PCR Master Mix 系列,核心区别只有一个:是否含溴酚蓝染料。10102ES后续可直接进行凝胶电泳。而 10103ES中无溴酚蓝指示剂,电泳时需要添加DNA loading buffer。
不建议,PCR Mx 中含有影响 PAGE 胶电泳的成分。推荐使用2× Hieff® PCR Master Mix for PAGE(Cat No.10160ES)
可能原因:模板量太低(CT 值 35 左右)。推荐 Ct 值:15<Ct<30。原因:Ct 值太大(如 Ct>30),刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。b)循环次数太少(30 cycles);循环次数过少(如 35)导致刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。…
较低峰 Tm 在 80℃之前可能原因:存在引物二聚体(一般mRNA 反转录后定量,产物在 100-150bp 左右,峰对应 Tm 值为 80-90℃。若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值在 70-80℃之间。故会在 80℃以前出现一个峰, 80℃以后出现一个峰),模板浓度…
双峰Tm 都在 80℃以前的可能原因:做 MicroRNA 定量时存在引物二聚体。Micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十 bp,峰对应 Tm 值也在 70-80℃之间。故会在 80℃ 以前出现双峰。…
可能原因:引物特异性过差导致非特异性产物扩增。交叉污染。c)gDNA 污染,可通过 NRC 进行确认。解决方案:Blast 检查引物特异性,差则重新设计引物。超净台中操作,注意更换 Tip 头,避免交叉污染。c)通过 NRC 阴性对照进行确认,若有,需重新制备模板。
可能原因:扩增产物是完全的引物二聚体,可能是未加模板。注:若 microRNA,则结果正常(做 microRNA 定量时存在引物二聚体。micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应 Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值…
可能原因:存在大小相近的非特异性扩增解决方案:a)温度跨度不高于 7℃,视为可用结果(即 Tm 值跨度<7℃可认为是同一种产物);b)进行高浓度琼脂糖电泳(高分辨率),确认是否为单一条带。
ROX 是一种参比染料,其作用是标准化荧光定量反应中的非PCR 震荡,校正加样误差或者是孔与孔之间的误差,提供一个稳定的基线。
常用 2 步法。需提高扩增特异性,可选用 2 步法或提高退火温度。在扩增效率低, ct 值过大的时候,可以改用 3 步法或延长延伸时间。
有效性要满足三个条件:(1)标准曲线:扩增效率范围:90-110%,对应斜率为 -3--3.5。 R2>0.98。 (扩增效率=10-1/斜率-1),当斜率=-3.32 时,扩增效率=100%。(2)扩 增曲线:S 型曲线,且 Ct 值在 15-35 之间,阴性对照 Ct>35 或无 Ct 值。(…
同样的扩增产物也会出现Tm 值有微小差异,一般差异在 1 度以内都可以接受。
一般 CT 值与模板起始浓度呈负相关,浓度越高,CT 值越小。但也有很多特殊情况, 比如体系中存在抑制物或是模板不纯,这时候稀释模板反而能使 CT 值变低。
可能是目的基因为低丰度表达基因导致。建议:a)换用内参;b)换引物;c)换检测线性范围更广的qPCR mix。