可以先混合大体系,再分别加到离心管里面,最后加模板;枪头加样不要把空气打进去,二档吸样,一档打样品;缓慢推出液体,不要吹打;沿着壁打入到孔内;另外配置完后,如果还有气泡,离心PCR管去除。如果是96孔板,移液完后轻轻敲96孔板。
沉淀是稳定剂冻存后溶解度下降析出形成的,不影响产品性能。建议解冻后上下颠倒,枪头吹打混匀至沉淀消失。若仍未溶解,可离心后取液体,请避免取到该沉淀。
11185特异性更好,灵敏度更高,平台期荧光信号值更高。
(1)X 表示模板 DNA 量需要实验者在首次实验时进行摸索。首先对模板DNA 进行稀释(一般推荐 5-10 倍),然后模板量梯度上样,选择 CT 值落在 20-30 之间的最佳上样量。(2)常用的量是逆转录 500-1000ng 总RNA,稀释 10 倍取 1μL cDNA 进行qPCR 实验…
(1)有效性要满足三个条件:(1)标准曲线:扩增效率范围:90-110%,对应斜率为-3--3.5。R2>0.98。 (扩增效率=10-1/斜率-1),当斜率=-3.32 时,扩增效率=100%。(2)扩增曲线:S 型曲线,且 Ct 值在 15-35 之间,阴性对照 Ct>35 或无Ct 值。(3)…
可能原因:a)RNA 纯度低,体系中存在较多杂质;推荐参数:OD260/OD280=1.8-2.0, OD260/OD230>2.0。随着 qPCR 反应的进行,阻碍反应的因素不断增加,若 RNA 纯度低,杂质多,会进一步影响仪器平台期的算法,导致出现锯齿状。b)仪器长时间未做校准。仪器未校准会使仪…
可能原因:a)模板量太低(CT 值 35 左右)。推荐 Ct 值:15<Ct<30。原因:Ct 值太大(如 Ct>30),刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。 b)循环次数太少(30 cycles);循环次数过少(如 35)导致刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平…
较低峰 Tm 在 80℃之前可能原因:存在引物二聚体(一般mRNA 反转录后定量,产物在 100-150bp 左右,峰对应 Tm 值为 80-90℃。若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值在 70-80℃之间。故会在 80℃以前出现一个峰, 80℃以后出现一个峰),模板浓度…
双峰Tm 都在 80℃以前的可能原因:做 MicroRNA 定量时存在引物二聚体。Micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十 bp,峰对应 Tm 值也在 70-80℃之间。故会在 80℃ 以前出现双峰。…
可能原因:a)引物特异性过差导致非特异性产物扩增。b)交叉污染。c)gDNA 污染,可通过 NRC 进行确认。解决方案:a)Blast 检查引物特异性,差则重新设计引物。b)超净台中操作,注意更换 Tip 头,避免交叉污染。通过 NRC 阴性对照进行确认,若有,需重新制备模板。
可能原因:扩增产物是完全的引物二聚体,可能是未加模板。注:若 microRNA,则结果正常(做 microRNA 定量时存在引物二聚体。micro RNA 反转录后定量, 产物在 80-90bp 左右,峰对应 Tm 值为 70-80℃,若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值…
可能原因:存在大小相近的非特异性扩增解决方案:a)温度跨度不高于 7℃,视为可用结果(即 Tm 值跨度<7℃可认为是同一种产物);b)进行高浓度琼脂糖电泳(高分辨率),确认是否为单一条带。
(1)X 表示模板 DNA 量需要实验者在首次实验时进行摸索。首先对模板DNA 进行稀释(一般推荐 5-10 倍),然后模板量梯度上样,选择 CT 值落在 20-30 之间的最佳上样量。(2)常用的量是逆转录 500-1000ng 总RNA,稀释 10 倍取 1μL cDNA 进行qPCR 实验…
(1)有效性要满足三个条件:(1)标准曲线:扩增效率范围:90-110%,对应斜率为-3--3.5。R2>0.98。 (扩增效率=10-1/斜率-1),当斜率=-3.32 时,扩增效率=100%。(2)扩增曲线:S 型曲线,且 Ct 值在 15-35 之间,阴性对照 Ct>35 或无Ct 值。(3)…
可能原因:a)RNA 纯度低,体系中存在较多杂质;推荐参数:OD260/OD280=1.8-2.0, OD260/OD230>2.0。随着 qPCR 反应的进行,阻碍反应的因素不断增加,若 RNA 纯度低,杂质多,会进一步影响仪器平台期的算法,导致出现锯齿状。b)仪器长时间未做校准。仪器未校准会使仪…
可能原因:a)模板量太低(CT 值 35 左右)。推荐 Ct 值:15<Ct<30。原因:Ct 值太大(如 Ct>30),刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平台期。 b)循环次数太少(30 cycles);循环次数过少(如 35)导致刚进入指数扩增期几个循环就停止了反应,故无法到达平…
较低峰 Tm 在 80℃之前可能原因:存在引物二聚体(一般mRNA 反转录后定量,产物在 100-150bp 左右,峰对应 Tm 值为 80-90℃。若有引物二聚体存在,引物二聚体大小只有几十bp,峰对应 Tm 值在 70-80℃之间。故会在 80℃以前出现一个峰, 80℃以后出现一个峰),模板浓度…
应用于病毒检测,特点是高检出率
加样误差。加大模板稀释倍数,提高加样体积,使不同稀释度的加样体积更准确;标准品降解。重新制备标准品;模板浓度太高。存在反应抑制,增加模板稀释倍数; 引物扩增特异性不好。重新设计引物。
反应循环数不够,可适当增加循环次数。一般设置为 40,需注意过多的循环会增加背景信号,降低数据可信度;确认程序中是否设置了信号采集步骤。三步法扩增程序应该将信号采集设置在 72℃延伸阶段, 两步法一般在退火延伸阶段收集;确认引物是否降解。长时间未使用的引物应先通过PAGE 电泳检测完整性; 模板浓度…