核酸提取试剂盒用于FFPE组织效果不稳定，有推荐吗？

FFPE样本优先选标注适配FFPE/石蜡切片的试剂盒，而不是只做细胞或血液的通用DNA。重点看脱蜡后蛋白酶K消化体系、是否有去交联步骤、洗脱缓冲液pH。A260/280偏低常提示蛋白或酚类残留，可比较供应商是否提供低残留洗涤方案、自动化磁珠适配和批次质检报告。选型时可拿历史样本做平行验证：同一切片、同一脱蜡条件，比较产量、片段分布、文库插入片段和覆盖率，而不只看OD。

如果暂不换试剂盒，可先把FFPE流程标准化：切片厚度、脱蜡时间、乙醇洗涤、蛋白酶K用量和温度要固定。石蜡组织交联重时，可在裂解后做一次70-80℃短孵育再降温，减少去交联不足；蛋白酶K也可分两次加，避免消化不充分。洗脱建议用低盐弱碱缓冲液，洗脱体积不要过小，否则后续稀释误差大。提取后可用Qubit看实际回收，用片段分析仪看是否过度降解，再决定是否调整消化和洗涤。