选购指南PCR替代方案!超全等温扩增RPA产品选择指南,助力现场快速检测!
重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)是Piepenburg等人在2006年利用重组酶、单链DNA结合蛋白和链置换DNA聚合酶等开发出的一种新的核酸恒温扩增技术。该技术能够在10~30 min内进行恒温(37~42℃)下的单分子核酸检测,它具有反应灵敏度高、特异性强、对仪器依赖程度低且可整合多种检
重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA)是Piepenburg等人在2006年利用重组酶、单链DNA结合蛋白和链置换DNA聚合酶等开发出的一种新的核酸恒温扩增技术。该技术能够在10~30 min内进行恒温(37~42℃)下的单分子核酸检测,它具有反应灵敏度高、特异性强、对仪器依赖程度低且可整合多种检测模式等优点,特别适用于基层和现场即时检测,可广泛应用于体外诊断、兽医、食品安全、生物安全、农业等领域,有望成为聚合酶链式反应 (PCR) 替代方案。
RPA技术简介
RPA技术的原理是重组酶蛋白与引物(A)形成复合物,能在双链DNA中寻找同源序列(B)。然后通过重组酶(C)的链置换活性将引物插入同源位点,并且单链结合蛋白稳定置换DNA链(D)。随后重组酶被分解,使得引物的3'末端被链置换并与DNA聚合酶结合(E),使其延长引物(F),通过循环重复该过程对模板上的目标区域进行指数式扩增。

图1. RPA等温扩增技术原理图
RPA技术检测方法
基础型RPA检测方案,仅需在反应体系中加入一对特异性引物进行扩增,然后对扩增产物进行纯化,再进行琼脂糖凝胶电泳即可实现对检测结果的判读。
向基础型RPA反应体系中加入核酸外切酶Ⅲ(exonucleaseⅢ,exo)和exo荧光探针,或加入甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(formamide pyrimidine DNA glycosylase,fpg)和fpg荧光探针,用荧光定量仪来实时检测RPA反应。
1) exo探针法:在RPA的基础上,加入了核酸外切酶III(exonuclease III,即exo)和exo荧光探针,核酸外切酶III会特异地切割荧光探针(THF位点),荧光基团与淬灭基团分开,发出荧光信号,通过荧光收集的仪器来实时监控荧光值的变化。

图2. exo探针法检测原理图
2)fpg探针法:在RPA的基础上,加入甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(fpg)及fpg荧光探针,当探针与模板结合时,fpg酶识别dR连接臂(dR group)并切割该位点,使得荧光基团与淬灭基团分开,发出荧光信号,通过荧光收集的仪器来实时监控荧光值的变化。

图3. fpg探针法检测原理图
在RPA的基础上,加入核酸外切酶Ⅳ(endonuclease Ⅳ,即nfo)、nfo探针和生物素标记的反向引物。当nfo探针与模板链互补时,核酸外切酶Ⅳ识别并切割THF残基位点,扩增获得既有探针标记物又有引物标记物的扩增子。然后加入对应的标记抗体,就能看到试纸条检测线上的结果条带。

图4. NFO探针法检测原理图
翌圣RPA体系核心原料
翌圣Zyme Editor™ 酶改造平台针对RPA技术,目前已获得RPA全系列性能优良的产品,包括链置换Bsu DNA polymerase、T4 UvsX Recombinase、T4 UvsY protein、T4 gene 32 protein、Exonuclease III等,搭配通用的扩增反应液,可满足不同用户对于各种检测体系的探索。同时,翌圣生物核心应用研发团队,经过缓冲液中各种离子配比的调试、酶的组合优化、多种辅因子添加等开发了适用于荧光型、层析型、电泳型三种方法进行核酸检测的常规液体型RPA预混液以及冻干粉形式,使用时只需加入特异性引物/探针、模板,30min左右即可完成检测,满足各种应用场景的快速检测需求。
电泳型RPA预混液部分数据展示
不同GC含量和片段长度扩增

图5. (A) 16727扩增不同GC含量靶标;(B)16727扩增不同长度靶标
使用16727ES依次扩增GC含量为40%-70%的靶标及长度100bp-500bp的靶标,阳性均能够出现明显、唯一的电泳条带,阴性均无明显条带,表明该产品对于不同GC含量及不同长度的靶标均能完成扩增。
稳定性测试

图6. (A) 16728正常保存稳定性测试;(B)16728冻融10次稳定性测试;(C)16728在37℃放置5天稳定性测试
考察16728的反复冻融和热加速稳定性,使用干冰将16728试剂反复冻融10次或者将16728在37℃条件下放置5天后,与正常保存的16728试剂,同时检测两个浓度靶标(P1-10 copies/μL,P2-2 copies/μL),不同条件处理的16728试剂,两个浓度电泳条带明显、唯一,表明16728试剂稳定性良好。
灵敏度

图7. 16727和友商产品灵敏度比较
使用16727和市面上同类产品,同时检测竞品试剂盒中梯度稀释的阳性对照模板,检测结果显示,16727检测灵敏度更有优势。
翌圣RPA产品选择指南
产品大类 | 产品名称 | 产品货号 | 产品类型/作用 |
RPA Kit (液体型) | DNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16702ES | 荧光型RPA Kit(Exo探针法) |
RNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16708ES | 荧光型RT-RPA Kit(Exo探针法) | |
DNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16725ES | 层析型RPA Kit(Nfo探针法) | |
RNA Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16726ES | 层析型RT-RPA Kit(Nfo探针法) | |
DNA Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16727ES | 电泳型RPA Kit | |
RNA Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16728ES | 电泳型RT-RPAKit | |
RPA Kit (冻干粉) | DNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16904ES | 荧光型RPA (Exo探针法)(原位冻干粉) |
RNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit(Fluorescent) | 16905ES | 荧光型RT-RPA(Exo探针法)(原位冻干粉) | |
DNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16906ES | 层析型RPA (Nfo探针法)(原位冻干粉) | |
RNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit(Chromatographi) | 16907ES | 层析型RT-RPA(Nfo探针法)(原位冻干粉) | |
DNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16908ES | 电泳型RPA (原位冻干粉) | |
RNA Lyo Rapid Isothermal Amplification Kit (Basic) | 16909ES | 电泳型RT-RPA (原位冻干粉) | |
单组份 | 11078ES | 结合引物与原始靶核酸序列互补合成新的DNA模板 | |
11079ES | 具有配对和链转移活性的重组酶 | ||
11080ES | 重组酶辅助因子,刺激T4 UvsX的单链DNA依赖性ATP酶活性并降低活性所需的T4 UvsX临界浓度 | ||
11081ES | 参与DNA复制、修复、重组与解链后的单链DNA结合,防止自杂交 | ||
14502ES | 刺激ATP和肌酸分解为磷酸肌酸和ADP,释放能量 | ||
14525ES | 具有3’→5’外切酶活性,切断荧光探针中淬灭基团,释放荧光 | ||
2× RPA Amplification Buffer | 16928ES | RPA通用buffer |
站内暂未收录 · 可询价 图 RNA Rapid Isothermal Amplification Kit (...
站内暂未收录 · 可询价 图 DNA Lyo Rapid Isothermal Amplification K...
站内暂未收录 · 可询价 图 DNA Rapid Isothermal Amplification Kit (...
站内暂未收录 · 可询价 图 RNA Rapid Isothermal Amplification Kit (...
站内暂未收录 · 可询价 图 RNA Lyophilized Rapid Isothermal Amplifi...
站内暂未收录 · 可询价 图 T4 Gene 32 Protein, gp 32 (5 μg/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 Exonuclease III 核酸外切酶III (100 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 Bsu DNA polymerase (Large fragment, 5 U/...
站内暂未收录 · 可询价 图 Creatine Kinase (2 μg/μL)肌酸激酶
站内暂未收录 · 可询价 图 T4 UvsX Recombinase T4 UvsX重组酶 (2 μg/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 T4 UvsY protein T4 UvsY蛋白 (2 μg/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 Endonuclease IV 核酸内切酶IV (10 U/μL)
站内暂未收录 · 可询价 图 2× RPA Amplification Buffer 通用型RPA Buffe...
站内暂未收录 · 可询价 图 T4 gene 32 protein (gp 32) T4噬菌体基因32编码蛋白...
站内暂未收录 · 可询价