Techniques没有高质量的文库,NGS测序就是一场空?(附自动化建库全攻略)
随着高通量测序技术飞速发展,NGS自动化建库已成为实验室的“标配”。但你知道吗——在整个NGS测序流程中,有一个环节占据着绝对的C位,它就是:NGS文库构建。今天,我们就来聊清楚三件事:为什么文库构建是NGS测序的“心脏”?为什么建库必须走向自动化?DNA建库和RNA建库具体怎么做?自动化设备怎么选?文库构建:从样本到测序仪的“变形记”原始DNA、RNA核酸
随着高通量测序技术飞速发展,NGS自动化建库已成为实验室的“标配”。但你知道吗——在整个NGS测序流程中,有一个环节占据着绝对的C位,它就是:NGS文库构建。
今天,我们就来聊清楚三件事:
为什么文库构建是NGS测序的“心脏”?
为什么建库必须走向自动化?
DNA建库和RNA建库具体怎么做?自动化设备怎么选?
文库构建:从样本到测序仪的“变形记”
原始DNA、RNA核酸就像一堆杂乱无章的乐高积木,而测序仪只能读懂规整的“说明书”。文库构建,就是把这些积木变成测序仪能识别的标准零件。没有这一步,再好的样本、再贵的测序仪,都只能“干瞪眼”。
文库构建为何如此重要?
1.
测序平台的“入场券”
测序仪对样本有严格要求:片段长度要合适、浓度要达标、末端要平整……文库构建通过片段化处理、末端修复、接头连接等一系列操作,给原始核酸样本配上了“身份证”和“通行证”,让测序反应顺利启动。
2.
测序数据的“质检员”
你辛辛苦苦拿到测序数据,结果发现污染严重、覆盖不均、错误率高?——大概率是文库构建出了问题。文库构建中的扩增与质控步骤,直接决定了:
数据的准确性
测序的覆盖度
结果的可重复性
高质量文库 = 高质量数据,这个等式一点不夸张。
3.
自动化建库的“核心引擎”
自动化系统之所以能提效、降错、保质量,正是因为它精准地把控了文库构建的每一个环节。可以说,文库构建的自动化水平,决定了整个NGS自动化建库的天花板。
为什么NGS建库必须引入自动化?
先来看看手工操作的痛点有多现实:
步骤繁杂,极易出错:建库流程涉及数十次移液操作,每多一步就多一分出错的可能。
人工误差难以控制:加样体积偏差、磁珠吸附时间不均匀、混匀不充分……经验和状态直接影响结果。
批间一致性堪忧:同一批样本,上午做和下午做可能结果不一样;今天做和明天做也可能不一样。
耗时太长:典型96个样本的手工建库需要6-8小时甚至更长,实验人员筋疲力尽,效率却难提升。
自动化的三大核心价值:
✅ 标准化与可重复性:程序化操作确保每次实验条件高度一致,自动化记录可追溯,为质量审查提供可靠依据。
✅ 高通量与高效率:支持同时处理96、384甚至更多样本,实验人员从重复劳动中解放,专注科研创新。
✅ 数据质量显著提升:减少移液误差,避免交叉污染,还可节省10%-20%的高价值试剂。数据显示,自动化建库后文库产量的CV值可控制在6.62%左右,远优于手工操作。
自动化建库都做什么?
DNA建库 vs RNA建库
自动化建库,就是将文库构建中所有移液、混匀、孵育、纯化等操作交由自动化工作站完成。具体流程取决于样本类型。
🧬 DNA建库自动化流程(6步)
步骤
操作内容
1. 片段化 | 将高质量DNA切割成适合测序的片段(100-1000 bp,大多会在300 bp左右) |
2. 末端修复+加A尾 | 修复末端损伤,添加磷酸基团,3‘端加A尾 |
3. 接头连接 | 连接测序接头(适配体),这是测序仪识别的关键 |
4. 磁珠纯化 | 去除未连接的接头和引物 |
5. PCR扩增 | 扩增连接接头后的DNA片段,获得足够文库量 |
6. 文库定量与质控 | 检测浓度和片段大小,确保符合上机标准 |
🧬 RNA建库自动化流程(特殊在于先反转录)
RNA建库与DNA建库最大的不同:需要先将RNA反转录为cDNA,再进入DNA建库流程。
步骤
操作内容
1. RNA提取与纯化 | 获得高质量总RNA,进行rRNA去除或mRNA富集 |
2.RNA片段化 | 切割成适合测序的片段长度 |
3.反转录(RT) | 利用反转录酶将RNA片段转化为cDNA |
4. DNA建库流程 | 从末端修复、加A尾、接头连接、纯化、PCR到质控,全部自动化无缝衔接 |
自动化建库工作站怎么选?
市面上的自动化建库工作站种类繁多,国产设备主要是MGISP960、Ilab300等,进口设备有PE(Revvity)、Hamilton 哈密尔顿、Beckman贝克曼等。不同的建库类型以及建库通量,搭配的自动化配置可能不一样。
📌 怎么选?
看配置:不同的通量配置会有差异。
看后续服务:看售后及时度以及脚本维护情况。
看价格:设备采购价以及后续维护成本等。

写在最后
回归核心观点:文库构建是NGS测序的灵魂所在。自动化建库的意义,绝不仅仅是“解放双手”或“节省时间”,而是用标准化的程序、精准的控制和可靠的数据管理,确保每一次建库都能产出高质量的文库。
没有高质量的文库,再先进的测序仪也只能望洋兴叹。 而自动化建库,正是让这个过程从“靠经验”变成“靠标准”的关键一步。
无论是选择MGISP-960还是iLab-300或者其他自动化设备,它们都是实现这一目标的得力工具。
你的实验室目前在建库自动化方面有哪些经验或困惑?欢迎在评论区留言分享,我们一起交流进步!
翌圣提供自动化建库闭环方案的产品信息
产品分类 | 产品类型 | 产品名称 | 货号 |
仪器 | MGISP-960 | MGISP-960高通量自动化样品制备系统 | 80540ES |
iLab-300R | iLab-300自动样品制备系统 | 80542ES | |
ES-FR96荧光计 | 核酸定量仪荧光计Qubit(96通道) | ||
试剂 | DNA建库系列 | Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 一步法DNA酶切建库试剂盒V4(Illumina和MGI兼容) | |
RNA建库系列 | Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2 mRNA 捕获纯化试剂盒 | ||
Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit 核糖体去除试剂盒 | |||
Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant) | |||
Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads | |||
Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dUTP) 预混/预装板式RNA建库试剂盒 | |||
Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit (dNTP) 板式RNA建库试剂盒、预混版RNA建库试剂盒 | |||
甲基化建库 | Hieff® Mag Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit 超快速DNA亚硫酸氢盐转化试剂盒(磁珠法) | ||
Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for Illumina® V2 单链甲基化建库试剂盒 | |||
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina® 双链甲基化建库试剂盒(WGBS、RRBS适用) | |||
单细胞建库 | YeaCellTM DNA kit for single cell V2 | 12535ES | |
三代全长质粒建库 | Hieff® LongSeq Plasmid Fragmentation and Ligation Module(三代全长质粒建库) | ||
核酸清除剂 | Non-Corrosive Nucleic Acid Remover 无腐蚀核酸清除试剂 | ||
磁珠和定量试剂 | 纯化分选磁珠 | Hieff NGS® DNA selection Beads (Superior Ampure XP alternative)DNA纯化分选磁珠 | |
HS定量试剂 | 1× dsDNA HS Assay Kit 即用型dsDNA qubit定量试剂 | ||
BR定量试剂 | dsDNA BR Assay Kit/ BR 双链DNA定量检测试剂 | ||
耗材 | 自动化建库耗材 | 250 μL盒装滤芯透明无菌吸头 | |
96孔深孔板,U底(1.3 mL) | |||
0.2 mL 96孔PCR板,白色,全裙边 | |||
定量试剂搭配酶标板 | 96孔酶标板,不可拆卸,全黑(未TC处理) |
Not listed yet IMG Hieff NGS ® OnePot EvoMax DNA Library Pr...
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