Case StudiesMGISP-960 在16S测序中的应用：土壤DNA样本的自动化文库构建流程

目的：建立适用于土壤DNA的16S自动化建库流程

平台：MGISP-960（华大智造）

样本类型：土壤样本提取的DNA

可选择翌圣MolPure® Pro Soil/ StoolDNA Kit 增强版土壤/粪便 DNA 提取试剂盒（Cat#18527）。

该产品适配农田土、林地土、盐碱土、湿地淤泥、果园土、矿山土、栽培基质土、黑土、红土、黄土、沙土等。提取产物可进行土壤微生物 16S/ITS 高通量测序、宏基因组测序等。

下游应用：

16S 扩增子建库是通过提取样本总 DNA，利用特异性引物靶向扩增 16S rRNA 基因的高变区，并引入测序接头与样本标签，从而构建标准化测序文库的过程。该技术无需依赖微生物体外培养，即可高效、高通量地解析复杂环境中的细菌与古菌群落结构。

土壤 16S 扩增子建库的具体应用

• 土壤微生物多样性与群落结构解析：精准评估不同土壤样本中微生物的丰富度与均匀度（α多样性），以及不同生境间群落结构的差异（β多样性）。通过物种注释，全面揭示土壤中细菌和古菌在界、门、纲、目、科、属等分类阶元上的组成及相对丰度。
• 农业生态与土壤健康评估：研究根际微生物与植物生长的互作机制，评估不同耕作模式、施肥处理（如有机肥、化肥）或连作障碍对土壤微生态的影响。通过识别促生菌或病原菌的丰度变化，为土壤健康诊断与农业可持续发展提供数据支撑。
• 环境修复与污染监测：在重金属污染、石油降解、酸性矿水处理等环境治理场景中，追踪特定功能微生物（如降解菌、耐受菌）的演替规律。分析污染物胁迫下微生物群落的响应机制，评估生物修复效果及生态系统的恢复进程。
• 气候变化与生态响应研究：探究全球变暖、降水模式改变等极端气候事件对土壤微生物群落的影响。通过分析冷偏好型或暖偏好型细菌的丰度变化、微生物生态网络复杂性及碳降解基因响应，揭示土壤微生物在调节土壤碳氮循环和碳库动态中的核心机制。
• 极端与特殊生境微生物探索：针对冰川、火山、荒漠等极端环境下的土壤样本，挖掘适应极端条件的特殊微生物类群。研究这些特殊生境中微生物的生存策略、系统进化关系及其在地球生物化学循环中的潜在功能。

建库试剂盒：16S (V4) Bacterial AmpSeq Prep Kit For MGI /MGI平台16S扩增子建库试剂盒（Cat#12933）

文库类型：MGI文库

自动化耗材和数量：

实验条件：

翌圣生物产品解决方案：