News行业新标准!2026 DNA 甲基化样本前处理与检测技术专家共识
2026年8月,《中华预防医学杂志》正式刊发《DNA甲基化样本处理及检测技术专家共识》(以下简称“共识”)。为什么这份共识分量十足?DNA甲基化已成为肿瘤早筛、诊断、复发监测与疗效评估中应用最广的新型标志物。然而,检测涉及样本采集、前处理、核酸提取、转化、扩增检测与结果报告等多个复杂环节,不同实验室在平台、方法学、质控与解读上差异显著,直接影响结果互认。共识
然而,检测涉及样本采集、前处理、核酸提取、转化、扩增检测与结果报告等多个复杂环节,不同实验室在平台、方法学、质控与解读上差异显著,直接影响结果互认。
共识的发布,相当于为行业提供了一份“标准化操作地图”。
序号 | 核心推荐意见 | 证据/ 推荐 |
意见1 | 血液标本cfDNA受样本量、类型、采集管、质量、离心影响大;常规采集8~10 mL外周血分离血浆,EDTA抗凝并4 h内离心;溶血/黄疸/脂血为不合格样本;血浆-20℃或-80℃保存。 | 高 / 强推荐 |
意见2 | 建议采集晨尿,避免非尿液成分与微生物污染;采用含EDTA和抑菌剂的保存液储存尿液样本。 | 高 / 强推荐 |
意见3 | 建议采用均质化的粪便上清作为检测样本;采集后立即置于含EDTA和抑菌剂的专用保存液中。 | 高 / 强推荐 |
意见4 | 新鲜组织离体30 min内置预冷DNA稳定保存液或液氮速冻,长期-80℃以下;FFPE选1年内蜡块,病理指导下取肿瘤细胞富集区。 | 高 / 强推荐 |
意见5 | 痰液取晨起深部痰;肺泡灌洗液/胸腹水/脑脊液含血需抗凝;宫颈分泌物用专用采样刷在鳞柱交界区旋转采集。 | 中 / 强推荐 |
意见6 | 进行DNA甲基化检测时,推荐采用基于磁珠法的DNA提取方法;建议以DNA浓度和片段大小分析进行质控。 | 中 / 强推荐 |
意见7 | DNA转化效果直接影响结果可靠性;推荐使用最成熟、稳定的预处理方法——亚硫酸氢盐转化法(BS)。 | 高 / 强推荐 |
意见8 | 甲基化荧光定量PCR(MethyLight)适合靶基因特定位点/区域检测,成本低、速度快,适合临床实验室。 | 高 / 强推荐 |
意见9 | MSRE-PCR适用于有合适酶切位点的检测,因依赖对甲基化序列的识别,不推荐用于cfDNA样本。 | 中 / 弱推荐 |
意见10 | 对甲基化水平精确定量或低丰度DNA检测,推荐采用数字PCR(dPCR)法。 | 中 / 强推荐 |
意见11 | MS-HRM可灵敏检出低甲基化水平基因,适合具备HRM模块的qPCR平台,成本低、速度快。 | 中 / 弱推荐 |
意见12 | 焦磷酸测序是特定位点甲基化比例定量的经典方法,推荐作为临床特定位点检测的参照方法。 | 中 / 弱推荐 |
意见13 | 推荐WGBS、RRBS作为新型甲基化标志物筛选方法;三者(含质谱)成本高、操作复杂,不推荐用于日常临床筛查诊断。 | 强 / 强推荐 |
意见14 | 推动制定全国性行业标准,建立统一质控品与参考方法体系、多中心验证平台,逐步实现流程、临界值与报告的标准化、同质化与互认。 | 强 / 强推荐 |
甲基化标志物的含量在不同病程阶段差异巨大:癌症早期患者体液样本中的甲基化标志物往往处于痕量水平,而亚硫酸氢盐转化步骤本身还会造成DNA降解与片段化。因此共识对样本采集和前处理提出了明确红线:

血液
常规建议采集8~10 mL外周血分离3~4 mL血浆用于cfDNA甲基化检测;优先选血浆(较血清更稳定、核基因组DNA污染风险低)。分离血浆,初始低速离心800~1900xg,10min)用于沉淀血细胞,随后进行高速离心(14000~16000xg,10min)以清除残留细胞碎片并提高cfDNA纯度。

EDTA与ACD抗凝更适用于甲基化检测(肝素会剂量依赖性地干扰qPCR);血浆分离宜在4 h内完成,EDTA采血管临床上最常用,必要时使用cfDNA专用采血管。

溶血、黄疸、脂血样本应判为不合格,需联系临床重新采样。

尿液采集晨尿并加EDTA+抑菌剂保存液;粪便取均质化上清并立即入专用保存液;新鲜组织离体30 min内速冻,FFPE选1年内蜡块。
意见6:进行DNA甲基化检测时,推荐采用基于磁珠法的DNA提取方法。建议通过DNA浓度和片段大小分析对提取到的DNA进行质量控制。(证据等级:中,强推荐)
意见7:DNA转化效果直接影响检测结果的可靠性……推荐使用目前最为成熟、稳定的预处理方法——亚硫酸氢盐转化法。(证据等级:高,强推荐)
方法 | 优势 | 劣势 | 适用场景 |
甲基化特异性PCR(MSP) | 无需特殊仪器、成本低 | 半定量;引物设计难;灵敏度/特异度不高 | 科研初筛、定性验证 |
甲基化荧光定量PCR(MethyLight) | 灵敏度与特异度高 | 需特殊仪器;探针设计有难度 | 临床早筛、伴随诊断、中低通量定量 |
MSRE-PCR | 无需BS处理;仪器简单 | 酶切不完全致假阴性;仅检测酶切位点 | 特定酶切位点的中低通量检测 |
数字PCR(dPCR) | 绝对定量;灵敏度达单分子级 | 须结合BS或MSRE;仪器耗材贵 | 微量/低丰度样本、甲基化绝对定量 |
MS-HRM | 可半定量;无需探针、成本低 | 受相邻CpG状态影响;对温控精度要求高 | 大样本快速筛查、初步分型 |
焦磷酸测序 | 单碱基分辨率、可定量 | 仪器耗材贵;不适合全基因组 | 特定位点/短片段精确定量(参照方法) |
WGBS / RRBS | 全基因组/富集区单碱基分辨率 | 成本高、操作复杂、数据量大 | 新型标志物筛选(不推荐日常临床) |
质谱 | 可多重检测数十个CpG | 样本质量要求高;平台与人力成本高 | 临床多标志物联合检测、队列验证 |

1)甲基化转化
产品名称 | 货号 | 技术路线/ 备注 |
Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit 超快速柱式法 | BS转化(柱式) | |
Hieff® Mag Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit 超快速磁珠法 | BS转化(磁珠法,主推) | |
Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit 5 min超快速柱法 | BS转化(5 min柱法) | |
Recombinant Ten-Eleven Translocase 2.0(TET2.0, with buffer) | 酶法转化 TAPS | |
DNA Enzymatic methyl-Conversion Kit DNA酶法甲基化转化试剂盒 | 酶法转化 EM-seq |
2)甲基化片段化、建库与扩增
产品名称 | 货号 | 平台/ 应用 |
Hieff® UltraShear 甲基化片段化酶 | 样本打断,适配自动化 | |
Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for Illumina® V2 | Illumina 单链建库 | |
Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep Kit for MGI® V2 | MGI 单链建库 | |
Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit for Illumina® | Illumina 双链建库 | |
Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase(单酶) | 甲基化后PCR扩增 | |
Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polymerase mix | 甲基化后PCR扩增(预混) |
3)qPCR甲基化检测
产品名称 | 货号 | 应用 |
Universal TaqMan multiplex qPCR master mix(耐抑制) | qPCR预混液 | |
BioSensitive MethyProbe qPCR Master Mix | 甲基化qPCR预混液 |
4)科研方向修饰酶(RRBS / WGBS / TAB-seq / ACE-seq 等)
产品名称 | 货号 | 应用 |
HpaII(甲基化敏感性限制性内切酶) | RRBS / 酶切 | |
MspI | RRBS / 酶切 | |
TET酶 | TAB-seq(氧化5mC→5caC) | |
BGT酶 | 14552ES | TAB-seq 偶联 |
APOBEC酶 | ACE-seq(单碱基分辨率甲基化测序) |
Not listed yet IMG Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA ...
Not listed yet IMG AS-8351
Not listed yet IMG T4 Phage β-glucosyltransferase (T4-BGT) ...
Not listed yet IMG T4 Phage β-glucosyltransferase (T4-BGT) ...
Not listed yet IMG Hieff® DNA Bisulfite Conversion Kit / 柱法...
Not listed yet IMG Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep...
Not listed yet IMG Hieff NGS® Methyl-seq ssDNA Library Prep...
Not listed yet IMG DNA Enzymatic methyl-Conversion Kit DNA酶...
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Not listed yet IMG Hieff NGS® dsDNA Methyl Library Prep Kit...
Not listed yet IMG Recombinant APOBEC3A (A3A) Protein
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