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用ABI StepOnePlus做小鼠基因表达,ROX和染料法怎么选?

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提问:董飞飞 2026-09-18 浏览 198 5 个回答
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全部回答5
王
王琳宇 2026-09-17
10μl体系在StepOnePlus上可以用,但低模板或Ct偏高时移液误差对重复性影响大。建议10μl里cDNA加2-3μl,引物预混液先配好分装,用校准过的低吸附枪头,至少2个技术重复。若预算允许,20μl体系更稳,尤其边缘孔。成本控制在预算内需要找国产大包装,但不要牺牲封板膜和耗材质量。
周
周细胞2802 2026-09-12
低ROX买错不会完全不能定量,但会影响归一化,尤其孔间液量差异大时Ct漂移。组织样本Ct偏高,若cDNA稀释5倍和10倍变化不大,可能是目的基因表达低或引物设计不佳。建议同时跑一个内参基因(如GAPDH/Actb)看其Ct,如果内参也偏高可能是cDNA或RNA质量问题,而不是稀释倍数。10μl体系稳定性可用同一cDNA跑8-10个重复,看Ct SD是否小于0.3。
K
KevinExtract 2026-09-10
StepOnePlus一定要选带ROX的版本,通常低ROX兼容即可,不要买高ROX版本,高ROX是给7500/QuantStudio等仪器用的;买错时基线信号会异常,ΔRn可能被压低,但标准曲线做好仍可定量。为稳妥,拿到试剂第一板用标准品验证基线和扩增效率。Ct偏高先别怪试剂,组织cDNA稀释5-10倍不一定合适,可以做模板量梯度。
R
Rex9119 2026-09-15
单孔成本最好别只算试剂,要把引物、PCR板/封板膜、枪头都算进去。60多个样本如果每样2-3个重复,一批约200孔;选国产SYBR Green大包装一般能满足。关键是先验证引物特异性:熔解曲线单峰、琼脂糖胶无杂带,扩增效率90-110%。如果引物本身效率低,换ROX或便宜试剂都没用。StepOnePlus低ROX版本可买通用低ROX试剂。
谢
谢艳4199 2026-09-22
小鼠肝脏mRNA表达,组织cDNA我一般稀释5-20倍,但肝脏高丰度基因也可能稀释10倍仍Ct偏高,说明RNA质量或逆转录效率可能有问题。建议先测RNA浓度和A260/280,逆转录用等量RNA(如500ng),之后做原液、2倍、5倍、10倍梯度,选Ct落在15-30且线性好的稀释倍数。60多样本,别为了省一步稀释引入批间差。
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